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西安瑞禧最近開拓了新的科研方向——酶抑制劑靶點預測，其中包括藥物發現、藥物靶點預測、藥物靶標發現、先導化合物篩選、藥物設計服務、靶標預測服務、藥物虛擬篩選、藥物/小分子定制合成、化合物結構優化活性/藥物篩選、虛擬新藥篩選服務。本文小編主要介紹的是：分子對接篩選定制。

以SARS-CoV-S/ACE2復合蛋白和2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2) Mpro水解酶為靶標,從TCMSP數據庫中篩選SARS-CoV-2-ACE2結合阻斷劑和SARS-CoV-2 Mpro水解酶抑制劑,指導以中藥小分子為前體的抗SARS-CoV-2新藥的研發.方法:根據文獻報道,確定SARS-CoV-S/ACE2復合蛋白和SARS-CoV-2 Mpro水解酶晶體結構模型上的活性位點,利用LibDock分子對接技術虛擬篩選TCMSP數據庫中的小分子化合物,結合打分值以及化合物與靶蛋白受體的相互作用模式優化篩選結果,獲得具有抗SARS-CoV-2潛在活性的中藥小分子化合物.

結果:確定SARS-CoV-S/ACE2復合蛋白結構中位于結合表面上的ASP38,GLN42,GLN325,GLU329,TYR436和TYR491以及SARS-CoV-2 Mpro水解酶結構中的THR24,THR25,THR26,LEU27,ASN28和ASN119為本次分子對接的關鍵氨基酸;分子對接篩選得到20個能與關鍵氨基酸形成氫鍵的候選SARS-CoV-2-ACE2結合阻斷劑,其中主要來源于梔子,甘草,山豆根和洋金花的4個成分與靶蛋白的對接效果較好;篩選得到34個能與關鍵氨基酸形成氫鍵的候選SARS-CoV-2 Mpro水解酶抑制劑,其中主要來源于干姜,黃藥子,升麻,薺菜的4個成分與靶蛋白的對接效果較好;甘草成分甘草酚E和黃藥子成分延齡草苷元分別與靶蛋白作用的關鍵氨基酸數量最多或形成的氫鍵數量最多,分子對接效果良好.

結論:來源于中藥的4個SARS-CoV-2-ACE2結合阻斷劑和4個SARS-CoV-2 Mpro水解酶抑制劑具有潛在的抗SARS-CoV-2活性,其中甘草成分甘草酚E和黃藥子成分延齡草苷元可優先選擇進行后續抗SARS-CoV-2新藥的研發.

瑞禧酶抑制劑靶點預測相關方向：

藥物靶點評估

化合物庫定制

AI虛擬篩選藥物服務

分子對接篩選定制

藥效團篩選定制

靶中化合物設計

靶點及信號通路驗證