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熒光蛋白（fluorescent protein）屬于一種可視化的報告基因編碼蛋白，在一定的波長下可發出明亮熒光，它的特點有熒光穩定、容易檢測、對細胞無毒害、無需底物和無物種特異性等。常見的有綠色熒光蛋白、紅色熒光蛋白等。

綠色熒光蛋白（GFP）簡述及應用：
綠色熒光蛋白（GFP）是一個由約238個氨基酸組成的具有潛力的標記物，分子量約27kDa。熒光基團能夠自身催化組成生色團，通過紫外光或藍光激發時發出可見的綠色熒光，熒光性質穩定、具有無可比擬的優勢。
GFP的純化：
1、用PCR擴增出綠色熒光蛋白(GFP)基因
2、插入到pGEX-KG表達載體中,并將構建出的重組質粒命名為pKG- GFP
3、將重組載體導入大腸桿菌DH10β中,經IPTG誘導產生GST-GFP融合蛋白

紅色熒光蛋白（RFP）簡述及應用
紅色熒光蛋白（RFP）是一種會發光的蛋白質，通過它可以看到細胞的活動，進行更深入的研究。RFP異源二聚體是由ddRFPA1蛋白和ddRFPB1蛋白聚合而成。
RFP熒光對PNGase酶活性檢測：
1、利用定點突變將N-糖基化位點引入ddRFP
2、突變體在大腸桿菌里(無糖基化系統)表達后獲得紅色熒光二聚體
3、建立酵母表達系統(有糖基化系統)對蛋白進行表達,獲得糖基化蛋白產物
4、將蛋白做體外混合實驗,通過測定混合物去糖基化后的熒光強度變化檢測PNGase的活性

【熒光標記的組蛋白】：
FITC-Histone
CY3-Histone
CY5-Histone
CY5.5-Histone
CY7-Histone
CY7.5-Histone
ICG-Histone

【熒光標記血紅蛋白】：
Hemoglobin-CY5
Hemoglobin-CY3
Hemoglobin-CY5.5
Hemoglobin-CY7.5
Hemoglobin-CY7
Hemoglobin-FITC

【熒光標記核仁蛋白】：
Nucleohistone-CY5
Nucleohistone-CY3
Nucleohistone-CY5.5
Nucleohistone-CY7.5
Nucleohistone-CY7
Nucleohistone-ICG
Nucleohistone-FITC