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Cy3-COOH（羧酸修飾的Cy3熒光染料）是一種帶有羧酸基團的Cy3熒光染料，通常用于與氨基反應的化學修飾或共價結合。在生物標記、熒光成像及分子追蹤中，Cy3-COOH能夠方便地與各種生物分子（如蛋白質、肽鏈、核酸等）進行耦合，是一種活性良好的熒光標記物。

羧酸基團（-COOH）的功能：
反應性：Cy3上的羧酸基團可用于與氨基反應形成酰胺鍵，這通常通過活化劑（如EDC，1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亞胺）來促進反應。
共價結合：羧酸基團的存在允許它與各種氨基修飾的分子（如氨基酸、蛋白質、抗體、寡核苷酸等）共價結合，用于標記或修飾生物分子。

常見的修飾步驟：

1. 羧酸活化：

   • 使用EDC或其他羧酸活化劑將Cy3-COOH活化，生成中間產物O-酰脲化物。
   • 可進一步使用**NHS（N-羥基琥珀酰亞胺）**將其轉化為更穩定的NHS酯，以便與氨基分子反應。

2. 與氨基反應：

   • 將活化后的Cy3-COOH與含有自由氨基的分子（如蛋白質、肽、寡核苷酸等）反應，形成共價酰胺鍵。
   • 該步驟通常在pH 7-9的緩沖溶液中進行，以確保反應效率。

3. 純化：

   • 反應完成后，可通過透析、凝膠過濾等方式去除未反應的Cy3染料或副產物，獲得純化的Cy3標記分子。

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