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在生物醫學領域，CY5-PEG-DBCO可用于修飾生物分子，例如蛋白質、肽段或藥物分子。通過與生物分子的疊氮基團反應，PEG鏈可以連接到生物分子上，從而實現對生物分子的保護和功能化。

CY5的存在則可以實現生物分子的熒光標記，幫助研究人員觀察生物分子的分布和動態變化。此外，CY5-PEG-DBCO還可以用于制備納米粒子，通過與納米材料表面的疊氮基團反應，實現PEG鏈的接枝，提高納米粒子的穩定性和生物相容性。

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